1.01版本补丁：

1.01版补丁修复了游戏中的不少Exploit和Bug，并对平衡性进行了调整，还优化了视频播放功能。玩家可以通过游戏内置的升级系统更新。

　　1、Exploit修复：

　　Scrin Mastermind的Teleport Units的最大能力范围被缩小；
　　在Scrin的Phase Field支持下，GDI Engineers、Nod Saboteurs和Scrin Assimilators将无法再捕获建筑物。

　　2、Bug修复：

　　修复了在多玩家地图Deadly Sertao中Nod与Nod对战时偶尔会崩溃的问题；
　　修复了多玩家模式下自动切换地图时的问题；
　　修复了观看BattleCast回放时评论员解说偶尔无法停止的问题；
　　修复了回放文件的播放问题；
　　修复了游戏聊天窗口内占位符文本和聊天记录的错误问题。

1.02版本补丁：

　　1.01版补丁发布后仅仅两天，EA就又提供了《命令与征服3》的新补丁，版本号1.02。
　　与1.01版补丁进行了大量的修正和改变不同，1.02版补丁只涉及两个地方：
　　1、修正了自定义战役大厅(Custom Match Lobby)内可参加的战役经常刷新至名单顶部的错误。
　　2、改进了在线游戏或手动检查升级时的补丁更新机制，保证所有玩家都能获得游戏的最新版本。
　　玩家可以通过游戏内置的升级系统更新。

1.03版本补丁：

　　BUG修正
　　-修正了在游戏大厅和自动匹配搜索中会导致玩家意外掉线的错误
　　-修正了玩家在游戏大厅内在发送私人聊天信息后无法发表公共信息的错误